MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	CCG	2	6	53	58	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079554
2	NC_010480	TGGC	2	8	73	80	0 %	25 %	50 %	25 %	170079554
3	NC_010480	GCA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079554
4	NC_010480	GCTG	2	8	134	141	0 %	25 %	50 %	25 %	170079554
5	NC_010480	CGC	2	6	168	173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079554
6	NC_010480	ATG	2	6	227	232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079554
7	NC_010480	TTG	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079554
8	NC_010480	AGT	4	12	337	348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079554
9	NC_010480	GTG	2	6	386	391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079554
10	NC_010480	GCCGT	2	10	419	428	0 %	20 %	40 %	40 %	170079554
11	NC_010480	TTA	2	6	442	447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079554
12	NC_010480	CAG	2	6	457	462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079554
13	NC_010480	AGC	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079554
14	NC_010480	CAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079554
15	NC_010480	ATTT	2	8	605	612	25 %	75 %	0 %	0 %	170079554
16	NC_010480	ATT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079555
17	NC_010480	CGC	2	6	766	771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079555
18	NC_010480	GAT	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079555
19	NC_010480	CAG	2	6	929	934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079555
20	NC_010480	GAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079555
21	NC_010480	AGG	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079555
22	NC_010480	A	8	8	1080	1087	100 %	0 %	0 %	0 %	170079555
23	NC_010480	GTC	2	6	1171	1176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079555
24	NC_010480	CAAAG	2	10	1258	1267	60 %	0 %	20 %	20 %	170079555
25	NC_010480	A	6	6	1300	1305	100 %	0 %	0 %	0 %	170079555
26	NC_010480	TC	3	6	1333	1338	0 %	50 %	0 %	50 %	170079555
27	NC_010480	TGA	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079555
28	NC_010480	A	6	6	1558	1563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010480	A	6	6	1663	1668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010480	CCA	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010480	CTG	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010480	ATC	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079556
33	NC_010480	AGT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079556
34	NC_010480	TTA	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079556
35	NC_010480	CAG	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079556
36	NC_010480	CGC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079556
37	NC_010480	AAG	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079556
38	NC_010480	ATC	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079556
39	NC_010480	CAG	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079556
40	NC_010480	AATCG	2	10	2149	2158	40 %	20 %	20 %	20 %	170079556
41	NC_010480	T	7	7	2206	2212	0 %	100 %	0 %	0 %	170079556
42	NC_010480	GTT	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079556
43	NC_010480	TCA	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079556
44	NC_010480	ACC	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079556
45	NC_010480	CTG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079556
46	NC_010480	GTT	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079556
47	NC_010480	TTC	2	6	2636	2641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079556
48	NC_010480	ACG	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079556
49	NC_010480	GAG	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079556
50	NC_010480	ACC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079556
51	NC_010480	CGG	3	9	2946	2954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079556
52	NC_010480	ATT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079556
53	NC_010480	GCT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079556
54	NC_010480	AGT	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079556
55	NC_010480	TTC	2	6	3211	3216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079556
56	NC_010480	TCC	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079556
57	NC_010480	GGTCGA	2	12	3285	3296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170079556
58	NC_010480	TCG	2	6	3389	3394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079556
59	NC_010480	GAT	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079556
60	NC_010480	AGC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010480	T	7	7	3530	3536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010480	T	6	6	3567	3572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010480	GGAT	2	8	3579	3586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010480	A	6	6	3622	3627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010480	T	6	6	3659	3664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010480	TG	3	6	3728	3733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010480	ATG	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010480	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010480	A	6	6	3892	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010480	T	6	6	3942	3947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010480	GTG	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010480	ATC	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079557
73	NC_010480	ATT	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079557
74	NC_010480	GAT	2	6	4322	4327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079557
75	NC_010480	GCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079557
76	NC_010480	TC	3	6	4406	4411	0 %	50 %	0 %	50 %	170079557
77	NC_010480	CAA	2	6	4510	4515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079558
78	NC_010480	AAG	2	6	4535	4540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079558
79	NC_010480	AGA	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079558
80	NC_010480	T	6	6	4890	4895	0 %	100 %	0 %	0 %	170079559
81	NC_010480	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079559
82	NC_010480	AG	3	6	5104	5109	50 %	0 %	50 %	0 %	170079559
83	NC_010480	T	7	7	5119	5125	0 %	100 %	0 %	0 %	170079559
84	NC_010480	GGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079559
85	NC_010480	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079559
86	NC_010480	A	6	6	5299	5304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010480	A	8	8	5342	5349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010480	AGT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010480	T	6	6	5379	5384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010480	GAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010480	GC	3	6	5493	5498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010480	AG	4	8	5501	5508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010480	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010480	TGA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010480	TCA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079560
96	NC_010480	AAC	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
97	NC_010480	CGC	2	6	5777	5782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
98	NC_010480	CTG	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079560
99	NC_010480	GAA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
100	NC_010480	CAG	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
101	NC_010480	TGT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079560
102	NC_010480	CTG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079560
103	NC_010480	GGCG	2	8	5980	5987	0 %	0 %	75 %	25 %	170079560
104	NC_010480	CGC	2	6	6074	6079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
105	NC_010480	T	6	6	6124	6129	0 %	100 %	0 %	0 %	170079560
106	NC_010480	TCA	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079560
107	NC_010480	GAT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079560
108	NC_010480	AGCC	2	8	6186	6193	25 %	0 %	25 %	50 %	170079560
109	NC_010480	TTC	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079560
110	NC_010480	AAC	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
111	NC_010480	ACA	2	6	6341	6346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
112	NC_010480	GCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
113	NC_010480	ACGA	2	8	6378	6385	50 %	0 %	25 %	25 %	170079560
114	NC_010480	TC	3	6	6462	6467	0 %	50 %	0 %	50 %	170079560
115	NC_010480	A	6	6	6469	6474	100 %	0 %	0 %	0 %	170079560
116	NC_010480	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079560
117	NC_010480	GA	3	6	6581	6586	50 %	0 %	50 %	0 %	170079560
118	NC_010480	GGC	2	6	6596	6601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079560
119	NC_010480	GGCA	2	8	6634	6641	25 %	0 %	50 %	25 %	170079560
120	NC_010480	CAA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
121	NC_010480	T	6	6	6701	6706	0 %	100 %	0 %	0 %	170079560
122	NC_010480	CGC	2	6	6756	6761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
123	NC_010480	GTG	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079560
124	NC_010480	T	6	6	6976	6981	0 %	100 %	0 %	0 %	170079560
125	NC_010480	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079560
126	NC_010480	ATTT	2	8	7215	7222	25 %	75 %	0 %	0 %	170079560
127	NC_010480	AAG	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
128	NC_010480	ATTGCT	2	12	7257	7268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170079560
129	NC_010480	CGC	2	6	7355	7360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
130	NC_010480	CCA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079560
131	NC_010480	ACG	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
132	NC_010480	ACC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079560
133	NC_010480	GA	3	6	7615	7620	50 %	0 %	50 %	0 %	170079560
134	NC_010480	AGC	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
135	NC_010480	AGA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
136	NC_010480	CGC	2	6	7757	7762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
137	NC_010480	AGA	2	6	7802	7807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
138	NC_010480	TTA	2	6	8033	8038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079560
139	NC_010480	A	6	6	8055	8060	100 %	0 %	0 %	0 %	170079560
140	NC_010480	GAA	2	6	8127	8132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
141	NC_010480	A	6	6	8157	8162	100 %	0 %	0 %	0 %	170079560
142	NC_010480	AGG	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079560
143	NC_010480	AAT	2	6	8224	8229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079560
144	NC_010480	ACA	2	6	8242	8247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
145	NC_010480	CCG	2	6	8286	8291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
146	NC_010480	GCC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
147	NC_010480	ATG	2	6	8349	8354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
148	NC_010480	TCTCC	2	10	8360	8369	0 %	40 %	0 %	60 %	170079561
149	NC_010480	AGT	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
150	NC_010480	AGC	2	6	8398	8403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
151	NC_010480	CGC	2	6	8686	8691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
152	NC_010480	AGAA	2	8	8728	8735	75 %	0 %	25 %	0 %	170079561
153	NC_010480	CTGC	2	8	8750	8757	0 %	25 %	25 %	50 %	170079561
154	NC_010480	CAG	3	9	8771	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
155	NC_010480	GAC	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
156	NC_010480	AAC	2	6	9171	9176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
157	NC_010480	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079561
158	NC_010480	TGAT	2	8	9300	9307	25 %	50 %	25 %	0 %	170079561
159	NC_010480	GAT	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
160	NC_010480	CCG	2	6	9424	9429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
161	NC_010480	AAT	2	6	9470	9475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079561
162	NC_010480	AAG	2	6	9588	9593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079561
163	NC_010480	C	6	6	9594	9599	0 %	0 %	0 %	100 %	170079561
164	NC_010480	CAA	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
165	NC_010480	CAA	2	6	9741	9746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
166	NC_010480	TC	3	6	9784	9789	0 %	50 %	0 %	50 %	170079561
167	NC_010480	TCC	2	6	9849	9854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079561
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171	NC_010480	AGA	2	6	10014	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079561
172	NC_010480	A	6	6	10025	10030	100 %	0 %	0 %	0 %	170079561
173	NC_010480	TGG	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079561
174	NC_010480	CAG	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
175	NC_010480	CAA	2	6	10070	10075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
176	NC_010480	CTC	2	6	10133	10138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079561
177	NC_010480	ACTG	2	8	10153	10160	25 %	25 %	25 %	25 %	170079561
178	NC_010480	CTG	2	6	10167	10172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079561
179	NC_010480	CGT	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079561
180	NC_010480	CGT	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079561
181	NC_010480	C	7	7	10325	10331	0 %	0 %	0 %	100 %	170079561
182	NC_010480	CGC	2	6	10369	10374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
183	NC_010480	GGT	2	6	10393	10398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079561
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209	NC_010480	TTG	2	6	12442	12447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_010480	TTG	2	6	12960	12965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_010480	TTTGG	2	10	13870	13879	0 %	60 %	40 %	0 %	170079567
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243	NC_010480	TACA	2	8	14073	14080	50 %	25 %	0 %	25 %	170079567
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249	NC_010480	TGAC	2	8	14449	14456	25 %	25 %	25 %	25 %	170079567
250	NC_010480	TTG	2	6	14475	14480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079567
251	NC_010480	TAG	2	6	14528	14533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079567
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254	NC_010480	AAT	2	6	14638	14643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079568
255	NC_010480	GTC	2	6	14662	14667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079568
256	NC_010480	GAT	2	6	14691	14696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079568
257	NC_010480	TCA	2	6	14774	14779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079568
258	NC_010480	AAGCCC	2	12	14853	14864	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170079568
259	NC_010480	T	6	6	14919	14924	0 %	100 %	0 %	0 %	170079568
260	NC_010480	AG	3	6	15030	15035	50 %	0 %	50 %	0 %	170079568
261	NC_010480	ATC	2	6	15049	15054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079568
262	NC_010480	ATG	2	6	15076	15081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079568
263	NC_010480	TGAGCC	2	12	15256	15267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170079568
264	NC_010480	TTTA	2	8	15346	15353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010480	ATC	2	6	15372	15377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_010480	TCA	2	6	15410	15415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079569
267	NC_010480	CG	3	6	15432	15437	0 %	0 %	50 %	50 %	170079569
268	NC_010480	GTG	2	6	15518	15523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079569
269	NC_010480	GCTC	2	8	15610	15617	0 %	25 %	25 %	50 %	170079569
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277	NC_010480	TA	3	6	16099	16104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010480	CAGG	2	8	16220	16227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
279	NC_010480	ACA	2	6	16237	16242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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344	NC_010480	ATGTC	2	10	20082	20091	20 %	40 %	20 %	20 %	170079572
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352	NC_010480	ATTGA	2	10	20480	20489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
353	NC_010480	CAAC	2	8	20538	20545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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360	NC_010480	A	7	7	20877	20883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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